Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PDE6DO43924 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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