Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LANCL1O43813 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms