Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms