Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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