Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHP1O15259 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPHP1O15259 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms