Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L12C9JPN9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L12C9JPN9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms