Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLCA2A8K830 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms