Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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