Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCP1A6NGW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms