Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms