Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6BA6NDN3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms