Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms