Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms