Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XIRP2A4UGR9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms