Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms