Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms