Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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