Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms