Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMTA1Q9Y6Y1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms