Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL11Q9Y3B7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL11Q9Y3B7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL11Q9Y3B7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms