Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms