Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms