Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF2Q9UK05 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF2Q9UK05 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms