Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms