Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms