Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DBF4Q9UBU7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DBF4Q9UBU7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms