Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CC2D2AQ9P2K1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms