Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL9Q9P2J3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms