Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms