Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms