Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms