Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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