Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms