Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms