Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms