Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms