Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EHD4Q9H223 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms