Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED28Q9H204 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms