Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms