Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPESC1Q9GZL8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BPESC1Q9GZL8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BPESC1Q9GZL8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BPESC1Q9GZL8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPESC1Q9GZL8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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