Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms