Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms