Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms