Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms