Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms