Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms