Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms