Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms