Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms