Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms